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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:45:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Pig DNA sequence *** SEQUENCING IN PROGRESS *** from clone CH242-392I14.
CU019588.2:107006-107025
CTTGTTCAGTGGGTGAAGGATGTGAATTGC107006CACAAGCTTCAGTGGAAGTCGCAGATGCAGCTCAGATCCCTTGTTACCGT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjB14E23, BM1673.
AP010403.1:38759-38778
AACTTGATATATGAGTTGGTACTTAAATCT38759CACAAGCTTCAGTGGAAGTCTCATCATCACAATTCATATTTTTCTCTCTC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:4744160-4744179
AACTTGATATATGAGTTGGTACTTAAATCT4744160CACAAGCTTCAGTGGAAGTCTCATCATCACAATTCATATTTTTCTCTCTC
Sus scrofa scrofa breed NS chromosome 11.
CP071562.1:62467922-62467941
ACGGTAACAAGGGATCTGAGCTGCATCTGC62467922GACTTCCACTGAAGCTTGTGGCAATTCACATCCTTCACCCACTGAACAAG
Sus scrofa genome assembly, chromosome: 11.
OY997218.1:64271632-64271651
ACGGTAACAAGGGATCTGAGCTGCATCTGC64271632GACTTCCACTGAAGCTTGTGGCAATTCACATCCTTCACCCACTGAACAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACAAGCTTCAGTGGAAGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACAAGCTTCAGTGGAAGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.167 | 0.159 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACAAGCTTCAGTGGAAGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.264 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACTTCCACTGAAGCTTGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.266 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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