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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 12:06:52, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Pyrus communis mRNA, contig: lc19034.
FX627566.1:290-309
AGCAAATAACAATGGACAAAACCCACGGGC290CACAGCATCCCAAGAGACAATAGCCATGACATTTCTTCAGTCTTTGGTTA
TSA: Pyrus x bretschneideri Unigene9346_XinShao mRNA sequence.
JR604469.1:271-290
AGCAAATAACAATGGACAAAACCCACGGGC271CACAGCATCCCAAGAGACAATAGCCATGACCTTTCTTCAGTCTTTGGTTA
TSA: Pyrus pyrifolia mRNA, contig: contig_21582.
FX401684.1:484-503
TAACCAAAGACTGAAGAAAGGTCATGGCTA484TTGTCTCTTGGGATGCTGTGGCCCGTGGGTTTTGTCCATTGTTATTTGCT
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 2.
OY757069.1:15719456-15719475
TAACCAAAGACTGAAGAAAGGTCCTGGCTA15719456TTGTCTCTTGGGATGCTGTGGCCTGTGGGTTTTGTCCATTGTTATTTGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACAGCATCCCAAGAGACAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACAGCATCCCAAGAGACAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.174 | 0.165 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACAGCATCCCAAGAGACAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.274 | 0.100 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGTCTCTTGGGATGCTGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.275 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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