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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:06:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 4.
CP123879.1:12552990-12553009
GATCTTTTATTCCGGTTCGAGTCGGTTAAA12552990CACATTTTGGTTCAATTCGGTTTTTAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
Brassica napus genome assembly, chromosome: A09.
HG994363.1:12016343-12016362
GATCTTTTATTCCGGTTCGAGTCGGTTAAA12016343CACATTTTGGTTCAATTCGGTTTTTAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
Meconema thalassinum genome assembly, chromosome: X.
OX336389.2:12313107-12313126
TTACTCGCAGGGTTCCAAAGGGTAAGTATA12313107CACATTTTGGTTCAATTCGGTGAAACTGTGTAGATTTGGACCAAAGGGCC
Meconema thalassinum genome assembly, chromosome: 5.
OX336393.1:444122871-444122890
TTATTCGCAGAGTTCGAAAGGGTAAGTGTG444122871CACATTTTGGTTCAATTCGGTAAAATGGTGTCGATTTGTGCCAAAGGGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACATTTTGGTTCAATTCGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACATTTTGGTTCAATTCGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.113 | 0.104 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACATTTTGGTTCAATTCGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.141 | 0.028 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGAATTGAACCAAAATGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.141 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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