GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-25 21:19:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Vigna angularis mRNA, clone: VES05J10.
HX944187.1:159-178
GGATTTTAGTATTAGATTTCCCAGTTTTCA159CACCAAAGTGGTATCGTGGATGAAGAGAAGTCTCACAAAGTGGTAAAGAA
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 2, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015035.1:10516421-10516440
GGATTTTAGTATTAGATTTCCCAGTTTTCA10516421CACCAAAGTGGTATCGTGGATGAAGAGAAGTCTCACAAAGTGGTAAAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACCAAAGTGGTATCGtGGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACCAAAGTGGTATCGtGGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.458 | 0.449 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACCAAAGTGGTATCGTGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.566 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCACGATACCACTTTGGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.566 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).