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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 12:51:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL100g03_r, 5'end.
AU197168.1:112-131
CTGGTGCGCAGTTTTTTCTTCATCGCTGCC112CACCTGTTGCCTAACCAAGGCGGTGCCGACGGTGCGTACGCGGCGGGGGC
Porphyra yezoensis cDNA clone:PM062e10_r, 5' end.
AV435801.1:219-238
CTGGTGCGCAGTTTTTTCTTCATCGCTGCC219CACCTGTTGCCTAACCAAGGCGGTGCCGACGGTGCGTACGCGGCGGGGGC
Sepioteuthis lessoniana genome assembly, chromosome: 14.
OY757917.1:3758212-3758231
CGCCTAAGGAGGGCAGACTAAGTTTTTTAG3758212CCTTGGTTAGGCAACAGGTGTAGATGAGGGAAAACTGAATTAAAACCAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACCTGTTGCCTAACCAAGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACCTGTTGCCTAACCAAGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.184 | 0.175 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACCTGTTGCCTAACCAAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.280 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTTGGTTAGGCAACAGGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.281 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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