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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:46:11, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS43N17.
DH961625.1:181-200
TTATCCCAAACCCTAATCCTAACTAAACTA181CACTCACCCACCCATTTTTCTCTTAGCACACACCCACCTTACCAACACAC
Onchidella celtica genome assembly, chromosome: 3.
OZ007569.1:51396975-51396994
CTCACCCATCCATCCACCCACCCACTCACT51396975CACTCACCCACCCATTTTTCTATCTGGCTGCAAAGTTAACAGATGCATAG
Sepia lycidas genome assembly, chromosome: 18.
OZ010588.1:103382173-103382192
TCGGATTCCCGGGTCAAGGCACTCTGCTGA103382173CACTCACCCACCCATTTTTCAAGATCCCGTTCTAGACTGGCAGCATTTTC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B02.
CP030994.1:38500700-38500719
GTGTGTTGGTAAGGTGGGTGTGTGCTAAGA38500700GAAAAATGGGTGGGTGAGTGTAGTTTAGTTAGGATTAGGGTTTGGGATAA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 02.
CP049893.1:38689394-38689413
GTGTGTTGGTAAGGTGGGTGTGTGCTAAGA38689394GAAAAATGGGTGGGTGAGTGTAGTTTAGTTAGGATTAGGGTTTGGGATAA
Thysanoteuthis rhombus genome assembly, chromosome: 19.
OY735216.1:21576054-21576073
GAAAATGCTGCCAGCCTGGAGCGGGATCTT21576054GAAAAATGGGTGGGTGAGTGTCAGCAGAGTGCCTTGACCCGGGAATCCGA
Sepiola atlantica genome assembly, chromosome: 15.
OY744529.1:110306108-110306127
GAAAATGCTGCCAGCCTGGAACGAGATCTT110306108GAAAAATGGGTGGGTGAGTGTCAGCAGAGTGCCTTGACCCGGGAATCTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACTCACCCACCCATTTTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACTCACCCACCCATTTTTC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.171 | 0.162 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACTCACCCACCCATTTTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.264 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAAAATGGGTGGGTGAGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.267 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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