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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-15 16:43:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Chionomys nivalis genome assembly, chromosome: 5.
OX465453.1:26767037-26767056
GTCTTATCTACAGGTTAAGGGAACGTCAAA26767037CACTCCCTTCAGCATGGTTTACACATCTTCTCAACCCTGCTCTGGAATTT
Trifolium repens mRNA, clone: WCC22i06_085, unspecified EST.
FY461838.1:48-67
CCCTTCTCACACTTCCCGGAAACTTCTCTT48CACTCCCTTCAGCATGGTTTTTTCCTTCACATCATTTTCATCTAATACTA
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Occ.
CP125842.1:261472-261491
TAGTATTAGATGAAAATGATGTGAAGGAAA261472AAACCATGCTGAAGGGAGTGAAGAGAAGTTTCCGAGAAGTGTGAGAAGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACTCCCTTCAGCATGGTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACTCCCTTCAGCATGGTTT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.196 | 0.187 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACTCCCTTCAGCATGGTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.232 | 0.036 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAACCATGCTGAAGGGAGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.233 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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