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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:05:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

EST_crog_evp_904899 crog_evp Caligus rogercresseyi cDNA clone crog_evp_503_099_fwd 5', mRNA sequence.
FK870247.1:586-609
CCATCTATGAAGGTTATGCACTTCCCCACG586CCATACTCCGTCTTGACCTTGCTGGACGTGAACTCACCAACTACTTGATGAAGA
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 9.
CP093351.1:43703050-43703073
CCATCTACGAAGGATATGCCCTTCCCCATG43703050CCATACTCCGTCTTGACCTTGCTGGTCGTGATCTGACTGATGCACTTATGAAGA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 9.
CP125309.1:42134071-42134094
CCATCTACGAAGGATATGCCCTTCCCCATG42134071CCATACTCCGTCTTGACCTTGCTGGTCGTGATCTGACTGATGCACTTATGAAGA
Caligus rogercresseyi clone crog-evp-503-099 Actin, muscle putative mRNA, complete cds.
BT076643.1:586-609
CCATCTATGAAGGTTATGCACTTCCCCACG586CCATACTCCGTCTTGACCTTGCTGGACGTGAACTCACCAACTACTTGATGAAGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGCAAGGTCAAGACGGAGTATGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGCAAGGTCAAGACGGAGTATGG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.186 | 0.178 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGCAAGGTCAAGACGGAGTATGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.362 | 0.175 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCATACTCCGTCTTGACCTTGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.365 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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