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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-06 20:16:45, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL045b10_r, 5'end.
AU193426.1:214-233
TTGAAGTGGTGCCCTCCATCCGTGACGTCA214CAGCCACCGAGTTTCACTCTGTGTTGACACCGGCAGACTCCCCCTTCCTC
Accipiter gentilis genome assembly, chromosome: 7.
OV839367.1:12915689-12915708
GGGGGGGGCGGTGCGCGTGTGCGACCGTTG12915689CAGCCACCGAGTTTCACTCTTGCCGGCTGAGTTCCCCCTTGGGCAGCGGA
Aesculus hippocastanum genome assembly, chromosome: 5.
OZ240843.1:17248184-17248203
ACACTCGGATGTATGACAAAATGTCAATTT17248184AGAGTGAAACTCGGTGGCTGGCACACAGCGGCGTATGATCTGATCCAGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGCCACCGAGTTTCACTCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGCCACCGAGTTTCACTCT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.608 | 0.599 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CAGCCACCGAGTTTCACTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
1.122 | 0.514 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=AGAGTGAAACTCGGTGGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
1.123 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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