GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:49:50, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lycaena phlaeas genome assembly, chromosome: 11.
HG995174.1:875887-875906
TACAAAGCTGATCCCTCGCCATCTCATCCT875887CAGCTATTGGAAAGGTTTGTGGGATTCTAATGGTCCTAAATTAGTAGAGG
Andrena praecox genome assembly, chromosome: 5.
OZ010732.1:39440471-39440490
AAGTCTACAAGAACCTCAATATTAAATATT39440471CAGCTATTGGAAAGGTTTGTTATTATCTGAAAAAAATAATTATTACCAGT
Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 7.
OY754324.1:3059526-3059545
ACAAGTTCGAATTTAAGTGTAAACAATTTT3059526ACAAACCTTTCCAATAGCTGCGGTGGTGTTTCCTGCAGCATCAAGAGCAT
Andrena fulva genome assembly, chromosome: 6.
OX276332.1:11862607-11862626
CTGGTAATAATTATTTTTTTTCAGATAATC11862607ACAAACCTTTCCAATAGCTGAATATTTAATATTGAGGTTCTTCTAGACTT
Pollenia griseotomentosa genome assembly, chromosome: 4.
OZ007563.1:87991625-87991644
TTTTGTCAAAAAAAAACTAAAATAAGGAAA87991625ACAAACCTTTCCAATAGCTGTTTACGATGTTGTACTTGCACTGTCGAAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGCTATTGGAAAGGTTTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGCTATTGGAAAGGTTTGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.105 | 0.096 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGCTATTGGAAAGGTTTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.130 | 0.026 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACAAACCTTTCCAATAGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.133 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).