GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-12-17 01:38:56, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

csa02-1ms2-c04 Csa02 Cucumis sativus cDNA clone csa02-1ms2-c04 5', mRNA sequence.
CK757042.1:108-127
TGATAACCAATATATTCAACGACTCTCATT108CAGCTGTTCGAGATTCCGAGCTAGTGTTTGCTATTAATAGTTAGCTGATC
Gossypium rotundifolium isolate GPK201 chromosome 4.
CP106725.1:56644962-56644981
TACTATTGATGAGAGATCTAAATCCTTACC56644962CTCGGAATCTCGAACAGCTGATATATGTGGTTTCTCTCCGATAGATGGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGCTGTTCGAGATTCCGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGCTGTTCGAGATTCCGAG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.291 | 0.282 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CAGCTGTTCGAGATTCCGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.417 | 0.126 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CTCGGAATCTCGAACAGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.418 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).