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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 21:01:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Raphanus sativus mRNA, clone: RSCS05N18, 5' end sequence.
FY447859.1:329-348
TGATGGTCTTGCAGCCATTGCAGTAGCTTG329CAGGTTCGGTTCAAAACACACAAATAACCTCTATTCTTTATTTTGGATAA
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 6.
LR778315.1:33771059-33771078
TGATGGTCTTGCAGCCATTGCAGTAGCTTG33771059CAGGTTCGGTTCAAAACACACAAATAACCTCTCTTCTTTATTTTGGATAA
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 3.
OY743209.1:1751223-1751242
TTATCCAAAATAAAGAAGAGAGGTTATTTG1751223TGTGTTTTGAACCGAACCTGCAAGCTACTGCAATGGCTGCAAGACCATCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGGTTCGGTTCAAAACACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGGTTCGGTTCAAAACACA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.445 | 0.436 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGGTTCGGTTCAAAACACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.564 | 0.119 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTGTTTTGAACCGAACCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.565 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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