GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-05 10:32:29, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 1.
CP141910.1:39484036-39484057
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT39484036CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 1.
CP141910.1:39512657-39512678
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT39512657CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 1.
CP141927.1:28990701-28990722
TTAATTAAATTGGGCTGATTTTGTTTTTCT28990701CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 1.
CP141927.1:29013449-29013470
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT29013449CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 1.
CP141927.1:29023991-29024012
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT29023991CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141953.1:27131156-27131177
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT27131156CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141953.1:27310633-27310654
TTAATTAAATTGGGTTGACTCTGTTTTTCT27310633CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141953.1:27350133-27350154
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT27350133CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141970.1:28879730-28879751
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT28879730CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141970.1:28939448-28939469
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT28939448CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141970.1:28996538-28996559
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT28996538CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 1.
CP143358.1:28600739-28600760
TTAATTAAATTGGGCTGATTTTGTTTTTCT28600739CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 1.
CP143358.1:28642057-28642078
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT28642057CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 1.
CP143375.1:27391854-27391875
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT27391854CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar Red Fuji chromosome 1.
CP147793.1:28575727-28575748
CTTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTCT28575727CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar Red Fuji chromosome 1.
CP147810.1:27761205-27761226
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT27761205CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus ioensis cultivar PI590015 chromosome 1.
CP154724.1:27460214-27460235
TTAATTTAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT27460214CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus ioensis cultivar PI590015 chromosome 1.
CP154724.1:27752612-27752633
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT27752612CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Chaenomeles sinensis isolate sampleA chromosome 06.
CP162369.1:23538699-23538720
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT23538699CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCGTAAACAGTATATGTAG
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 1B.
CP165684.1:29152571-29152592
TTAATTAAATTGGGCTGATTTTGTTTTTCT29152571CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 1B.
CP165684.1:29193889-29193910
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT29193889CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 1A.
CP165701.1:28421117-28421138
TTAATTAAATTGGGCTGATTTTGTTTTTCT28421117CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 1A.
CP165701.1:28462435-28462456
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT28462435CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar Golden Delicious chromosome 01.
CP168765.1:27464156-27464177
TTAATTAAATTGGGCTGATTTTGTTTTTCT27464156CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar Golden Delicious chromosome 01.
CP168765.1:27505474-27505495
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT27505474CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica cultivar Golden Delicious chromosome 01.
CP168782.1:27755808-27755829
CTTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTCT27755808CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 1.
OU696503.1:25309056-25309077
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT25309056CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 1.
OU696503.1:25373445-25373466
TTAATTAAGTTGGGCTGATTCTGTTTTTCT25373445CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU696677.1:25318160-25318181
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT25318160CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744542.1:29101723-29101744
TTAATTAAATTGAGCTGATTCTGTTTTTCT29101723CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744542.1:29143028-29143049
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT29143028CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744542.1:29153422-29153443
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT29153422CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744953.1:28504984-28505005
TTAATTAAATTGGGCTGATTTTGTTTTTCT28504984CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744953.1:28546302-28546323
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT28546302CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744991.1:25575284-25575305
TTAATTAAATTGAGCTGATTCTGTTTTTCT25575284CATACAAATCAAAGCACAACCCAGATTTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744991.1:25616592-25616613
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT25616592CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744991.1:25626986-25627007
TTAATTAAATTGGGCTGATTCTGTTTTTCT25626986CATACAAATCAAAGCACAACCCAGAATTCCAATTCATAAACAATATATGTAG
Malus ioensis cultivar PI590015 chromosome 1.
CP154741.1:4405687-4405708
CTACATATATTGTTTATGAATTGGAATTCT4405687GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Malus ioensis cultivar PI590015 chromosome 1.
CP154741.1:4707234-4707255
CTACATATATTGTTTATGAATTGGAAATCT4707234GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 12.
OY720336.1:4992808-4992829
CTACATATATTGTTTATGAATTGGAATTCT4992808GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Crataegus laevigata genome assembly, chromosome: 14.
OY756951.1:4901096-4901117
TCTACATTATTGTTTATGAATTGGAATTCT4901096GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 16.
OY757083.1:3797033-3797054
CTACATATATTGTTTACGAATTGGAATTCT3797033GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 16.
OY757083.1:3826781-3826802
CTACATATATTGTTTACGAATTGGAATTCT3826781GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Karpatiosorbus bristoliensis genome assembly, chromosome: 15C.
OZ287419.1:3786651-3786672
CTACATATATTGTTTATGAATTGGAATTCT3786651GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Karpatiosorbus bristoliensis genome assembly, chromosome: 15A.
OZ287469.1:3790616-3790637
CTACATATATTGTTTATGAATTGGAATTCT3790616GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA
Karpatiosorbus bristoliensis genome assembly, chromosome: 15B.
OZ287470.1:4390311-4390332
CTACATATATTGTTTATGAATTGGAAATCT4390311GGGTTGTGCTTTGATTTGTATGAGAAAAACAGAATCAGCCCAATTTAATTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATACAAATCAAAGCACAACCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATACAAATCAAAGCACAACCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.373 | 0.364 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CATACAAATCAAAGCACAACCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.697 | 0.325 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GGGTTGTGCTTTGATTTGTATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=13
0.704 | 0.006 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).