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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 21:33:19, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Allium cepa genome assembly, chromosome: 4.
LR994632.1:57385170-57385194
TTTATTGTTAAAGATGATTGCAAAAACTAA57385170CATCCACTTGATGTGCATCTACTTATCCATATTTACTGCAATAAGTAACCTGAAA
Allium cepa genome assembly, chromosome: 7.
LR994635.1:228394912-228394936
TTTATTGTTAAAGATGATTGCAAAAACTAA228394912CATCCACTTGATGTGCATCTACTTATCCAGATTTACTGCAACAAGTAACCTGAAA
TSA: Allium cepa CUDHLF2_12180 mRNA sequence.
JR854998.1:428-452
TCTTCCAATACTTGTTGCGGTAAATCTGGA428TAAGTAGATGCACATCAAGTGGATGTTAGCTTTTGCAATCATCTTTAACAACAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATCCACTTGATGTGCATCTACTTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATCCACTTGATGTGCATCTACTTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.321 | 0.312 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATCCACTTGATGTGCATCTACTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.450 | 0.129 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAAGTAGATGCACATCAAGTGGATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.451 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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