GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:08:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GL-XY-001_AF-002_E12 Xylem vascular tissue, differentiating (EUGL-XY) Eucalyptus globulus cDNA clone GL-XY-001_AF-002_E12 5', mRNA sequence.
JK634901.1:156-179
GTAACAATTGGTGACCTCGGGAACTGGGAC156CATCGCCTTCGTGCTTTCAATTACAAGTACTGGTCGGGGATCCTTGCTCTATTT
GL-XY-001_RS-037_H07 Xylem vascular tissue, differentiating (EUGL-XY) Eucalyptus globulus cDNA clone GL-XY-001_RS-037_H07 5', mRNA sequence.
JK644870.1:287-310
AAATAGAGCAAGGATCCACGAACAGTACTT287GTAATTGAAAGCACGAAGGCGATGGTCGCAGTTCCCGAGGTCACCAATTGTTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATCGCCTTCGTGCTTTCAATTAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATCGCCTTCGTGCTTTCAATTAC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.427 | 0.419 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATCGCCTTCGTGCTTTCAATTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.597 | 0.170 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAATTGAAAGCACGAAGGCGATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.598 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).