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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-04 18:33:16, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 7.
CP093349.1:39247940-39247959
ATGTTTCGCATCTCTCTGATAATAAGAAGG39247940CATCTCCGGAAGGAAACAATTTTCTTTTATAGCAAACCAATCAGTTAATG
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 7.
CP125307.1:39329746-39329765
ATGTTTCGCATCTCTCTGATAATAAGAAGG39329746CATCTCCGGAAGGAAACAATTTTCTTTTATAGCAAACCAATCAGTTAATG
Poa chaixii genome assembly, chromosome: 1.
OZ173740.1:221685956-221685975
TCCTTCTTGTCGATCGTTTGCAAAAATGCT221685956ATTGTTTCCTTCCGGAGATGACAGATACCACAGATCGAGACTGTCGGCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATCTCCGGAAGGAAACAAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATCTCCGGAAGGAAACAAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.091 | 0.082 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CATCTCCGGAAGGAAACAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.106 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ATTGTTTCCTTCCGGAGATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.107 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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