GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:47:18, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Populus nigra genome assembly, chromosome: 7.
OX637678.1:3098684-3098705
GTCAGATTATGTCACATGTCTAGAACTTCA3098684CATGCTTCATTTGATGCAATTGCAGTTGGAGATATACAGCCGATGTTACAAC
Chymomyza fuscimana genome assembly, chromosome: 2.
OX465089.1:552507-552528
TGGCTATAGGCGAGAGTATAGAAAGGTTGT552507CATGCTTCATTTGATGCAATTGAAAGCCCCTAAAACCTCCATCCCATCCCCC
Fagus sylvatica genome assembly, chromosome: 8.
OU015768.1:32843090-32843111
GTTACTTGTCAACTCAACTTGCATCATAAG32843090CAATTGCATCAAATGAAGCATGATGCTCACCTCATACTGTGCTTGCCCACCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATGCTTCATTTGATGCAATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATGCTTCATTTGATGCAATTG | format : html | download : | debug : 

0.014 | 0.014 | search_start;
0.220 | 0.206 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATGCTTCATTTGATGCAATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.314 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATTGCATCAAATGAAGCATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.315 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).