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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 01:05:11, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT16O03, TM0805.
AP010091.1:67579-67598
ATTGCCACTACCAATAACAGTGACTTTATT67579CATGGCGTTTAATTTTCAGCTGGGCAATGGGGTAGGAAGAGAGAGAAGAA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:116245755-116245774
ATTGCCACTACCAATAACAGTGACTTTATT116245755CATGGCGTTTAATTTTCAGCTGGGCAATGGGGTAGGAAGAGAGAGAAGAA
Hofmannophila pseudospretella genome assembly, chromosome: 15.
OX376326.1:13522251-13522270
TTTTTTTCATACACTTGTATGTTGGTATAA13522251CATGGCGTTTAATTTTCAGCAAGCTCTTTGTTTACTAGTAACATACAGAC
Geotrupes spiniger genome assembly, chromosome: 7.
OY390737.1:26787748-26787767
AGAAAACACTTTCGCTAATTGTAATGCTAA26787748CATGGCGTTTAATTTTCAGCATATTTAAATATCTCATTATTCCACACCGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATGGCGTTTAATTTTCAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATGGCGTTTAATTTTCAGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.304 | 0.295 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATGGCGTTTAATTTTCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.410 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGAAAATTAAACGCCATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.410 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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