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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 11:52:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS43M02.
DH961699.1:15-34
CTCAGCCGCCTCGC15CATTGTTGCCGTAGAGGGTTTTGCCACTGTTGAGGAGAAGACACCGTTGC
Arachis hypogaea DNA, clone: SAAC0708O17.
DH962709.1:315-334
GCAACGGTGTCTTCTCCTCAACAGTGGCAA315AACCCTCTACGGCAACAATGGCGAGGCGGCTGAGCTCGTCAACGACGGTG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B01.
CP030993.1:65204648-65204667
GCAACGGTGTCTTCTCCTCAACAGTGGCAA65204648AACCCTCTACGGCAACAATGGCGAGGCGGCTGAGCTCGTCAACGACGGTG
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 01.
CP049892.1:66075652-66075671
GCAACGGTGTCTTCTCCTCAACAGTGGCAA66075652AACCCTCTACGGCAACAATGGCGAGGCGGCTGAGCTCGTCAACGACGGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATTGTTGCCGTAGAGGGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATTGTTGCCGTAGAGGGTT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.128 | 0.119 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATTGTTGCCGTAGAGGGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.176 | 0.048 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACCCTCTACGGCAACAATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.178 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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