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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-05 14:53:18, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES04O21, 5' end sequence.
FY383956.1:108-132
GAATAATATACGTACTAATTTAACTTGATA108CATTTTCAAACACAATAATCTCTCGATTTCTATATATATATATATATGAAGCAAA
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.312.C1.
FX297094.1:597-621
TTTGCTTCATATATATATATATATAGAAAT597CGAGAGATTATTGTGTTTGAAAATGTATCAAGTTAAATTAGTACGTATATTATTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CATTTTCAAACACAATAATCTCTCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CATTTTCAAACACAATAATCTCTCG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.459 | 0.451 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATTTTCAAACACAATAATCTCTCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.588 | 0.129 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGAGAGATTATTGTGTTTGAAAATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.589 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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