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2025-04-03 15:41:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 8.
CP141917.1:28950465-28950484
ACCGGCAGCTACCGAATTAAAACCCAAATG28950465CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCTAACGTCCCATCAGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 15.
CP141924.1:51543246-51543265
ACCCGCAGCTACCGAATTAAAACCCTAATG51543246CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCCAACGTCCCATCCGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 8.
CP141934.1:30703994-30704013
ACCGGCAGCTACCGAATTAAAACCCAAATG30703994CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCTAACGTCCCATCAGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 15.
CP141941.1:56116784-56116803
ACCCGCAGCTACCGAATTAAAACCCTAATG56116784CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCCAACGTCCCATCCGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 8.
CP141960.1:29285761-29285780
ACCGGCAGCTACCGAATTAAAACCCAAATG29285761CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCTAACGTCCCATCAGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 15.
CP141967.1:52710388-52710407
ACCCGCAGCTACCGAATTAAAACCCTAATG52710388CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCCAACGTCCCATCCGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 8.
CP141977.1:29214685-29214704
ACCGGCAGCTACCGAATTAAAACCCAAATG29214685CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCTAACGTCCCATCAGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 15.
CP141984.1:52299188-52299207
ACCCGCAGCTACCGAATTAAAACCCTAATG52299188CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCCAACGTCCCATCCGCCCG
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 1.
OY720325.1:51137782-51137801
ACCCGCAGCTACCGAATTAAAACCCTAATG51137782CCAAAGGACCATAGCAGCATTCAATACCATGCCAACGTCCCATCCGCCCG
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 8.
CP143365.1:542360-542379
CGGGCTGATGGGACGTTAGCGTGGTATTGA542360ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 15.
CP143372.1:352679-352698
CGGGCGGATGGGACGTTGGCATGGTATTGA352679ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCGGGT
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 8.
CP143382.1:506466-506485
CGGGCTGATGGGACGTTAGCATGGTATTGA506466ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTTGGTAGCTGCCGGT
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 15.
CP143389.1:319510-319529
CGGGCGGATGGGACGTTGGCAGGGTATTGA319510ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCGGGG
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 8.
OU696510.1:557290-557309
CGGGCTGATGGGACGTTAGCATGGTATTGA557290ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 15.
OU696517.1:375352-375371
CGGGCGGATGGGACGTTGGCATGGTATTGA375352ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCGGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 8.
OU696684.1:583927-583946
CGGGCTGATGGGACGTTAGCATGGTATTGA583927ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 15.
OU696691.1:356699-356718
CGGGCGGATGGGACGTTGGCATGGTATTGA356699ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCGGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 8.
OU744549.1:569334-569353
CGGGCTGATGGGACGTTAGCATGGTATTGA569334ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 15.
OU744556.1:350424-350443
CGGGCGGATGGGACGTTGGCATGGTATTGA350424ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCGGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 8.
OU744960.1:573575-573594
CGGGCTGATGGGACGTTAGCATGGTATTGA573575ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 15.
OU744967.1:350177-350196
CGGGCGGATGGGACGTTGGCATGGTATTGA350177ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCGGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 8.
OU744998.1:539395-539414
CGGGCTGATGGGACGTTAGCGTGGTATTGA539395ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 15.
OU745005.1:354508-354527
CGGGCGGATGGGACGTTGGCATGGTATTGA354508ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCGGGT
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 16.
OY720340.1:534609-534628
CGGGCTGATGGGTCGTTAGGATGGTATTGA534609ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTTGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 1.
OY757068.1:312063-312082
CGGGTGGATGGGACGTTGGCATGGTATTGA312063ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGATAGCTGCAGGT
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 15.
OY757082.1:496808-496827
GGGCTGATGGGACATTTAGCATGGTATTGA496808ATGCTGCTATGGTCCTTTGGCATTAGGGTTTTAATTCGGTAGCTGCCGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCAAAGGACCATAGCAGCAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCAAAGGACCATAGCAGCAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.162 | 0.153 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAAAGGACCATAGCAGCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.261 | 0.099 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGCTGCTATGGTCCTTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=41
0.272 | 0.011 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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