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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:40:06, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 08.
CP049899.1:3912001-3912020
ATAGACTAAATGAAAGTTCTGATTTGTTTG3912001CCAACAACCCAAGGATGAAGTTTGGAGATAATTAAAAGAAATAATATTTA
Arachis hypogaea DNA, clone: 8iHA00A15, cultivar: YI-0311.
DE998448.1:518-537
TAAATATTATTTCTTTTAATTATCTCCAAA518CTTCATCCTTGGGTTGTTGGCAAACAAATCAGAACTTTCATTTAGTCTAT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A08.
CP030990.1:28243190-28243209
TAAATATTATTTCTTTTAATTATCTCCAAA28243190CTTCATCCTTGGGTTGTTGGCAAACAAATCAGAACTTTCATTAGTCTATC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCAACAACCCAAGGATGAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCAACAACCCAAGGATGAAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.276 | 0.267 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAACAACCCAAGGATGAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.374 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTCATCCTTGGGTTGTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.376 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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