GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-02-23 00:33:59, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Tussilago farfara genome assembly, chromosome: 23.
OZ208783.1:27594074-27594093
CATCTTCGGGATTAGATTTAGATACCAGAT27594074CCAACACTGGACCTACATTTGTGATAAATCAAACCTTTTGATATTCTCAT
Anopheles cruzii genome assembly, chromosome: 3RL.
OZ207245.1:74318998-74319017
TATTAAACACCATCGTGCTTTTGTAACAAC74318998CCAACACTGGACCTACATTTCGCTTGGCTCAAACAACTCTTTTTGCATAT
Adalia bipunctata genome assembly, chromosome: 4.
OU342951.1:15759960-15759979
ATATCTACAAATTTTCAGTCAAAAACTATA15759960AAATGTAGGTCCAGTGTTGGTTTTAAGAAAGCTTCAGTCTGGTTCATTTT
Eupeodes corollae genome assembly, chromosome: 1.
OX244023.1:165846465-165846484
CTGAAATTAGCCGTTAAGATTCGCCTTAAA165846465AAATGTAGGTCCAGTGTTGGAGATAGAACTTCGATTTCTTATATCCTAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCAACACTGGACCTACATTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCAACACTGGACCTACATTT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.107 | 0.098 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CCAACACTGGACCTACATTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.150 | 0.043 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AAATGTAGGTCCAGTGTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.151 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).