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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 13:08:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Prunus armeniaca aberrant testa shape (ATS) gene, complete cds.
KP283472.1:913-932
TACCTTAACTTAGAGTTCACGCTTGGAAGG913CCAACTGCCGAATGGACTGTGCTCAATAGCCTCAACCTTCAAATGACTTA
Prunus incisa isolate 462-2010A aberrant testa shape (ATS) gene, complete cds.
KP283473.1:892-911
TACCTTAACTTAGAGTTCACGCTTGGAAGG892CCAACTGCCGAATGGACTGTGCTCAATAGCCTCAACCTTCAAATGACTTA
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd01.
AP019297.1:30373896-30373915
TAAGTCATTTGAAGGTTGAGGCTATTGAGC30373896ACAGTCCATTCGGCAGTTGGCCTTCCAAGCGTGAACTCTAAGTTAAGGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCAACTGCCGAATGGACTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCAACTGCCGAATGGACTGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.185 | 0.176 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAACTGCCGAATGGACTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.278 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACAGTCCATTCGGCAGTTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.279 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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