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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 19:24:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Camellia sinensis tea_rep_c1295 mRNA sequence.
KA280736.1:61-81
ATACCTGCATCCAAAATCCCAACAAACACA61CCACAACAATCGGATACATAGTGTAGGGTGTATCCTCAAAATGTACGTAGA
Camellia sinensis mRNA, clone: TB23H10, 5' end sequence, expressed in terminal buds.
FS956091.1:343-363
TCTACGTACATTTTGAGGATACACCCTACA343CTATGTATCCGATTGTTGTGGTGTGTTTGTTGGGAAAATAAAATGCTTGAA
Camellia sinensis var. sinensis cultivar Shuchazao flavonoid 3',5'-hydroxylase (F3'5'H) gene, complete cds.
KX792116.1:6243-6263
TCTACGTACATTTTGAGGATACACCCTACA6243CTATGTATCCGATTGTTGTGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCACAACAATCGGATACATAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCACAACAATCGGATACATAG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.190 | 0.182 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCACAACAATCGGATACATAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.358 | 0.168 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTATGTATCCGATTGTTGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.359 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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