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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:26:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

pOP-CNI02051_EST_C_1_pSK_SK CNI (Oil Palm Non-Embryogenic Callus) Elaeis guineensis cDNA clone pOP-CNI02051 5', mRNA sequence.
EY405143.1:188-211
GGTATCGATACTTGTTTACATTACATCCCT188TGAATGAAGCAGCATCGCTTGTGGCATTGGCCTTG
pOP-EO04255_EST_C_1_pSK_SK EO (Oil Palm Embryoid) Elaeis guineensis cDNA clone pOP-EO04255 5', mRNA sequence.
EY411297.1:276-299
GGTATCGATACTTGTTTACATTACATCCCT276TGAATGAAGCAGCATCGCTTGTGGCATTGGCCTTG
Elaeis guineensis clone estEgSNP25 manganese superoxide dismutase (MnSOD) mRNA, complete cds.
JX438715.1:904-927
GGTATCGATACTTGTTTACATTACATCCCT904TGAATGAAGCAGCATCGCTTGTGGCATTGGCCTTGAACACACTTAACTGTTTCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCACAAGCGATGCTGCTTCATTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCACAAGCGATGCTGCTTCATTCA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.170 | 0.161 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCACAAGCGATGCTGCTTCATTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.471 | 0.301 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAATGAAGCAGCATCGCTTGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.474 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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