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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 16:13:50, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

sl26b10.y1 Gm-c1027 Glycine max cDNA clone GENOME SYSTEMS CLONE ID: Gm-c1027-2420 5', mRNA sequence.
AW756702.1:289-308
TGTATACCAGGATGATAGTGATATGATCGA289CCACGTACGTTGTACGCAGTAGTAGTACTCTAATTAACTGCGGAACTAAA
sv21f12.y1 Gm-c1057 Glycine soja cDNA clone GENOME SYSTEMS CLONE ID: Gm-c1057-287 5', mRNA sequence.
BF598779.1:282-301
ATACCAGGATGATAATGATATGATCATCGA282CCACGTACGTTGTACGCAGTAGCAGTACTCTAATTAACTACGGAAATAAA
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 11.
CP126436.1:39323134-39323153
GTTGCAGGATGATAATGATATGATCATCGA39323134CCACGTACGTTGTACGCAGTAGCAGTACTCTAATTAACTACGGAAATAAA
GM880006A10B10 Gm-r1088 Glycine max cDNA clone Gm-r1088-1987 3', mRNA sequence.
BU544983.1:281-300
TTTAGTTCCGCAGCTAATTAGAGTACTACT281ACTGCGTACAACGTACGTGGGCGATCATATCACTATCATCCTGGTATACA
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 18.
CP126443.1:2549385-2549404
TTTAGTTCCGCAGTTAATTAGAGTACTACT2549385ACTGCGTACAACGTACGTGGTCGATCATATCACTATCATCCTGCAACATG
Streptomyces sp. MMBL 11-1 chromosome, complete genome.
CP117709.1:5546255-5546274
CTCGACCTGGAGACCGACCCCGCCGCCCGT5546255ACTGCGTACAACGTACGTGGCACCCAGACCGTGCTCACCGCCGCGGCGGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCACGTACGTTGTACGCAGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCACGTACGTTGTACGCAGT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.302 | 0.294 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCACGTACGTTGTACGCAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.457 | 0.154 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTGCGTACAACGTACGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.458 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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