GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-02-21 09:53:27, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Salticus scenicus genome assembly, chromosome: 6.
OZ005653.1:334581112-334581131
CATACTGCCTCCCCCTCCTCCATCTTGGCG334581112CCACTCACCACTCCACCTTTCTCCTCCTCCTCTTGTATTAAAAAGTTGTA
Lissotriton helveticus genome assembly, chromosome: 6.
OZ180052.1:591828887-591828906
ACAACTCCTCCTGTCTCTCTCCTCACTGCC591828887CCACTCACCACTCCACCTTTCCTTTCTGTCCTCTCTCTGACACTCACACT
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 7.
CP158648.1:57259261-57259280
ATTTGTTGAAGTTGTTTGAATGGAACCCCA57259261AAAGGTGGAGTGGTGAGTGGTACAAAATAAACATATGGACAATTTTTAGT
Tamarix gallica genome assembly, chromosome: 8.
OZ123708.1:43923241-43923260
TCCAGGACAAACCCAACCCATGTTGCATGG43923241AAAGGTGGAGTGGTGAGTGGTTTCATATATCATATAAACATTAACCCACT
Melanostoma scalare genome assembly, chromosome: 1.
OX456984.1:44014144-44014163
AAGTGGTAGTAGTGAGATTTTGTGTAAAGT44014144AAAGGTGGAGTGGTGAGTGGAAGCTGTACTCAAAGTAGTAGAGGTGATTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCACTCACCACTCCACCTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCACTCACCACTCCACCTTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.113 | 0.104 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CCACTCACCACTCCACCTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.145 | 0.032 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AAAGGTGGAGTGGTGAGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.147 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).