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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:36:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 6.
OX392552.1:20851610-20851630
CGGGAAACGGGTGTTTATTATGATGTTCTG20851610CCATGAGGAAGATTCCTTGAGGTTTCCAGAACGCGACTTTTGCCTATGACT
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 6.
OX392561.1:20813194-20813214
CGGGAAACGGGTGTTTATTATGATGTTCTG20813194CCATGAGGAAGATTCCTTGAGGTTTCCAGAACGCGACTTTTGCCTATGACT
Lunularia cruciata genome assembly, chromosome: 2.
OX419756.1:38215390-38215410
CAATAAGAAACGTGATATTTATTTAGGAGC38215390CCATGAGGAAGATTCCTTGAGGAAATTCTCCACGCCCTAGCAATAAAAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCATGAGGAAGATTCCTTGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCATGAGGAAGATTCCTTGAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.319 | 0.311 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCATGAGGAAGATTCCTTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.406 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCAAGGAATCTTCCTCATGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.406 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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