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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-01-10 01:55:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd03.
AP019299.1:20317360-20317383
TTGGGGTCATCTGAGTCGCACCAGTTGAAC20317360CCATTTTGGTATTGTTTTGGTTTAGGGCTTAGAGAGCCCTAGAGAGAGAGAGAG
Prunus dulcis DNA, unplaced-scaffold_318.
AP020655.1:3816-3839
TTGGGGTCATCTGAGTCTCACCAGTTGAAC3816CCATTTTGGTATTGTTTTGGTTTAGGGCTTAGAGAGCCCGAGAGAGAGAGAGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCATTTTGGTATTGTTTTGGTTTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCATTTTGGTATTGTTTTGGTTTA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.343 | 0.335 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCATTTTGGTATTGTTTTGGTTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.454 | 0.110 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAAACCAAAACAATACCAAAATGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.454 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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