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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-05 17:12:03, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RFABE12TH Castor bean cDNA library from flowers,800bp Ricinus communis cDNA clone RFABE12, mRNA sequence.
EE258856.1:94-115
GATAAGTTCTCTCTCTCTGTTTTGTTCTGA94CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAAAGTTTTAATCTTTATTATTTGCAGAAGTAG
RFABQ03TH Castor bean cDNA library from flowers,800bp Ricinus communis cDNA clone RFABQ03, mRNA sequence.
EE260610.1:102-123
GATAAGTTCTCTCTCTCTGTTTTGTTCTGA102CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAAAGTTTTAATCTTTATTATTTGCAGAAGTAG
Holcus mollis genome assembly, chromosome: 8.
OZ286370.1:105127118-105127139
TGTTAAACTAGTACAGTTGGTTGCTGGTGC105127118CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAACCATTGGTTAATTACTGGCGCTGGTGTAGG
Holcus mollis genome assembly, chromosome: 8.
OZ286393.1:109782757-109782778
TGTTAAACTAGTACAGTTGGTTGCTGGTGC109782757CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAACCATTGGTTAATTACTGGCGCTGGTGTAGG
RFAA068TV Castor bean cDNA library from flowers,800bp Ricinus communis cDNA clone RFAA068, mRNA sequence.
EE254642.1:581-602
CTACTTCTGCAAATAATAAAGATTAAAACT581TTAGAGAGATCTGGGACTTGGGTCAGAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.358 | 0.349 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.563 | 0.204 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TTAGAGAGATCTGGGACTTGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.564 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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