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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 07:15:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RFABE12TH Castor bean cDNA library from flowers,800bp Ricinus communis cDNA clone RFABE12, mRNA sequence.
EE258856.1:94-115
GATAAGTTCTCTCTCTCTGTTTTGTTCTGA94CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAAAGTTTTAATCTTTATTATTTGCAGAAGTAG
RFABQ03TH Castor bean cDNA library from flowers,800bp Ricinus communis cDNA clone RFABQ03, mRNA sequence.
EE260610.1:102-123
GATAAGTTCTCTCTCTCTGTTTTGTTCTGA102CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAAAGTTTTAATCTTTATTATTTGCAGAAGTAG
RFAA068TV Castor bean cDNA library from flowers,800bp Ricinus communis cDNA clone RFAA068, mRNA sequence.
EE254642.1:581-602
CTACTTCTGCAAATAATAAAGATTAAAACT581TTAGAGAGATCTGGGACTTGGGTCAGAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.435 | 0.426 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCAAGTCCCAGATCTCTCTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.598 | 0.163 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTAGAGAGATCTGGGACTTGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.599 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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