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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-01 14:59:33, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK22848.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449857.1:40-59
GGCCTAGTTACGGGGGAGGGACGGAGTTAT40CCCCACGAGAAAATCTACTGCTCTCCCGCCTTCCCGCTCTTCCTCTTGAA
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 9.
CP158650.1:12356906-12356925
TTCAAGAGGAAGAGCGGGAAGGCGGGAGAG12356906CAGTAGATTTTCTCGTGGGGATAACTCCGTCCCTACCACCAAAGCCCCAC
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 9.
CP158660.1:12687229-12687248
TTCAAGAGGAAGAGCGGGAAGGCGGGAGAG12687229CAGTAGATTTTCTCGTGGGGATAACTCCGTCCCTACCACCAAAGCCCCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCCACGAGAAAATCTACTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCCACGAGAAAATCTACTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.118 | 0.109 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CCCCACGAGAAAATCTACTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.147 | 0.029 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CAGTAGATTTTCTCGTGGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.148 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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