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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-04 09:52:55, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 4.
CP093346.1:44725200-44725219
TGATTATTACAGGTTTGATGACACCCCAGT44725200TTTTAAGGCGATGTGGAGGGAGGCGAAGGAGTGCTTATATGTTGAACCTG
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 4.
CP125304.1:33015065-33015084
TGATTATTACAGGTTTGATGACACCCCAGT33015065TTTTAAGGCGATGTGGAGGGAGGCGAAGGAGTGCTTATATGTTGAACCTG
Crambe hispanica subsp. abyssinica omega-6 fatty acid desaturase (FAD2-C1) gene, complete cds.
JX964743.1:1053-1072
GGATTATTATCAGTTCGATGGAACACCAGT1053TTTTAAGGCGATGTGGAGGGAGGCGAAGGAGTGTATCTATGTGGAACCGG
Megalonotus praetextatus genome assembly, chromosome: 3.
OZ292239.1:11493877-11493896
AGCTATTGATGAGATCTCTGAGCCATCTCC11493877TTTTAAGGCGATGTGGAGGGTCGTATGGGTGTGTATTTCTGGATAGGTAT
Apotomis sororculana genome assembly, chromosome: 7.
OZ297064.1:15465979-15465998
TTGTGTATGATTGTCCCTTAATATTTTTTT15465979TTTTAAGGCGATGTGGAGGGAAAACGCGCTGGTTTTTTTAGTGGGTACAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCTCCACATCGCCTTAAAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCTCCACATCGCCTTAAAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.222 | 0.214 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CCCTCCACATCGCCTTAAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.402 | 0.179 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TTTTAAGGCGATGTGGAGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.406 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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