GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-12 00:30:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 4.
CP123879.1:2436704-2436724
AGCATCAACAACAGTGTTTTCATGCTCATA2436704CCCTCTCAACAAGGTATGCAATCTAATTCCATGTTAATTTAACATATATAT
Brassica napus genome assembly, chromosome: A09.
HG994363.1:2358513-2358533
AGCATCAACAACAGTGTTTTCATGCTCATA2358513CCCTCTCAACAAGGTATGCAATCTAATTCCATGTTAATTTAACATATATAT
Brassica rapa subsp. pekinensis cultivar Inbred line 'Chiifu' chromosome Cytogenetic chromosome 1 clone KBrH097M21, complete sequence.
AC155348.1:70695-70715
ATATATATGTTAAATTAACATGGAATTAGA70695TTGCATACCTTGTTGAGAGGGTATGAGCTTGAAAACACTGTTGTTGATGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCTCTCAACAAGGTATGCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCTCTCAACAAGGTATGCAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.404 | 0.395 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCTCTCAACAAGGTATGCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.500 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGCATACCTTGTTGAGAGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.501 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).