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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 17:58:39, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Eucalyptus camaldulensis mRNA, clone: EDS006O23, 5'-EST.
FY787029.1:158-183
TGTCGAGTTCCACATATTTATACACATTCT158CCCTCTTCGCCTCCCATCCAAACTGAAAGCCTACCCATCCTTCTTAAGCCGACTTT
Eucalyptus camaldulensis mRNA, clone: Leaf_004_000029C02, 5'-EST.
FY797414.1:161-186
TGTCGAGTTCCACATATTTATACACATTCT161CCCTCTTCGCCTCCCATCCAAACTGAAAGCCTACCCATCCTTCTTAAGCCGACTTT
EG_Bb118I07.R EG_Bb Eucalyptus grandis genomic 3', genomic survey sequence.
JM500648.1:351-376
AAAGTCGGCTTAAGAAGGATGGGTAGGCTT351TCAGTTTGGATGGGAGGCGAAGAGGGAAAATGTGTATAAATATGTGGAACTCGACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCTCTTCGCCTCCCATCCAAACTGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCTCTTCGCCTCCCATCCAAACTGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.448 | 0.439 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCTCTTCGCCTCCCATCCAAACTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.581 | 0.133 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAGTTTGGATGGGAGGCGAAGAGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.582 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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