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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:19:11, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Rutpela maculata genome assembly, chromosome: 3.
OW386287.2:1184731-1184749
TGCTTTATCACACTGTCGAGGTTTTAAAGA1184731TAGAATGGTGTGCGAAGGGATAAAATAAAAGTACCTTCTTATCACTCTC
Chorisops tibialis genome assembly, chromosome: 1.
OY770262.1:167814253-167814271
CCTTAATCAGCGGAAATGAATATTCGTAAA167814253TAGAATGGTGTGCGAAGGGTTAACAATCCATCCGTAATAAATAATGAAA
Chorisops tibialis genome assembly, chromosome: 3.
OY770264.1:17821898-17821916
CAAATACCGAAGATTATGATTTCATAAGTG17821898TAGAATGGTGTGCGAAGGGCTAACAACCCTTCCACAATAAGTAATGAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCTTCGCACACCATTCTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCTTCGCACACCATTCTA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.345 | 0.337 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCTTCGCACACCATTCTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.424 | 0.078 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAGAATGGTGTGCGAAGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.426 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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