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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:35:15, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig28694.
LM622291.1:1154-1173
CGGGGCGATCGATAGGGTCGCAAAGGCATG1154CCGATAGACAACGAGAACATAATGACTCATGCCATGGTTGAGGGAGACCT
Trididemnum nubilum genome assembly, chromosome: 10.
OZ014478.1:27397149-27397168
ACAATTTAGCTCGTTGCCTGACTCGCTGCT27397149CCGATAGACAACGAGAACATTTAATTGTTTATAATCAACACAGCTATACG
EG-A11_006_E06 Oil palm abnormal apex Lambda Zap Library Elaeis guineensis cDNA, mRNA sequence.
CN600053.1:221-240
AGGTCTCCCTCAACCATGGCATGAGTCATT221ATGTTCTCGTTGTCTATCGGCATGCCTTTGCGACCCTATCGATCGCCCCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCGATAGACAACGAGAACAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCGATAGACAACGAGAACAT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.286 | 0.277 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGATAGACAACGAGAACAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.408 | 0.123 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGTTCTCGTTGTCTATCGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.409 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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