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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-16 21:51:08, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 19.
CP151914.1:4196406-4196425
ATGATAGAATAGGTATGGCTGTGGTGCTCT4196406CCGCTGTCTCCTCACTAACCGGAGATGTTCTTGTATTCCTACGTCTTCTT
Brassica napus genome assembly, chromosome: C09.
HG994373.1:4808134-4808153
ATGATAGAATAGGTATGGCTGTGGTGCTCT4808134CCGCTGTCTCCTCACTAACCGGAGATGTTCTTGTATTCCTACGTCTTCTT
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C9.
LR031875.1:4974445-4974464
ATGATAGAATAGGTATGGCTGTGGTGCTCT4974445CCGCTGTCTCCTCACTAACCGGAGATGTTCTTGTATTCCTACGTCTTCTT
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 16.
CP123891.1:64354802-64354821
AAGAAGACGTAGGAATACAAGAACATCTCC64354802GGTTAGTGAGGAGACAGCGGAGAGCACCACAGCCATACCTATTCTATCAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCGCTGTCTCCTCACTAACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCGCTGTCTCCTCACTAACC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.330 | 0.321 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CCGCTGTCTCCTCACTAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.465 | 0.135 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GGTTAGTGAGGAGACAGCGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.466 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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