GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:35:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vescimonas fastidiosa MM35 DNA, complete genome.
AP023415.1:1087193-1087210
CCCGAGAGCTGCTCGGTGACCATTTCCTCG1087193CCGTAGAGGTTGCCATACAGTCGCAGCGCCAGGGAGAAGGGCCGCACC
Paraburkholderia busanensis strain P39.
CP058249.1:68509-68526
TAGGCCGCTTCGTAGAAGTCGCCGGGCTTG68509CCGTAGAGGTTGCCATACGCGCGCTGATAGCCGTTGACGATCATCGTC
Silurus aristotelis genome assembly, chromosome: 1.
OX327753.1:20930544-20930561
CTCTGGTCTTTAAGACTCATTCGACCCGGA20930544GTATGGCAACCTCTACGGCCTGGTCCGCGAGGGTGCCCCTGCTGGACA
Silurus aristotelis genome assembly, chromosome: 1.
OX327753.1:20930667-20930684
TTTCCGACCTCAACATCAAAGTCACTCGGA20930667GTATGGCAACCTCTACGGCCTGGTCCGCGAGGGTGCCCCTGCTGGACA
Paraburkholderia sp. D15 chromosome 2, complete sequence.
CP110396.1:2069331-2069348
GACGATGATCGTCAACGGCTATCAGCGCGC2069331GTATGGCAACCTCTACGGCAAGCCCGGCGACTTCTACGAAGCGGCCTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCGTAGAGGTTGCCATAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCGTAGAGGTTGCCATAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.124 | 0.115 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGTAGAGGTTGCCATAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.159 | 0.035 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTATGGCAACCTCTACGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.161 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).