GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:02:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Musa troglodytarum cultivar karat chromosome 7.
CP097509.1:9015828-9015847
CAATCTATAACACATACCATTCTCATGATG9015828CCTACAGCTGCACCTCATCAGAATTCTGGTCATAATAAACTTGAACATTT
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 7.
CP126376.1:33137532-33137551
AAATGTTCAAGTTTATTATGACCAGAATTC33137532TGATGAGGTGCAGCTGTAGGCATCATGAGATTGGTATGTGTTATAGATTG
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 18.
CP126387.1:32966984-32967003
AAATGTTCAAGTTTATTATGACCAGAATTC32966984TGATGAGGTGCAGCTGTAGGCATCATGAGATTGGTATGTGTTATAGATTG
Musa acuminata subsp. malaccensis strain Doubled-haploid Pahang (DH-Pahang) genome assembly, chromosome: A07.
HG996473.1:34033423-34033442
AATTGTTCAAGTTTATTATGACCAGAATTC34033423TGATGAGGTGCAGCTGTAGGCATCATGAGATTGGTATGTGTTATAGATTG
Musa schizocarpa genome assembly, chromosome: S07.
LS990920.1:37589644-37589663
AAATGTTCAAGTTTATTATGACCAGAATTC37589644TGATGAGGTGCAGCTGTAGGCATCATGAGATTGGTATGTGTTATAGATTG
Sympetrum striolatum genome assembly, chromosome: 11.
OX388351.1:48755717-48755736
AATTCATTGGATTGATAGATTAAATCACTG48755717TGATGAGGTGCAGCTGTAGGTTTACCTAATCTATGCATGTACTTATGACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTACAGCTGCACCTCATCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTACAGCTGCACCTCATCA | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
0.171 | 0.162 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTACAGCTGCACCTCATCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.261 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGATGAGGTGCAGCTGTAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.267 | 0.006 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).