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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:46:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A01.
CP030983.1:21615115-21615134
CCAAACAAAACAGTAAGTAAATTGCGTTTG21615115CCTAGCTCCATTTTTGCTGGTATATAAATTTCGAGTTTAAGGTTTGAGGA
Pyrrhosoma nymphula genome assembly, chromosome: 7.
OY754334.1:20736288-20736307
TATGCTATAGGATCTTATAATTCATCAAAA20736288CCTAGCTCCATTTTTGCTGGTCATAGCTAGATCACTCACAGGAATGGCCA
Meiosimyza decipiens genome assembly, chromosome: 1.
OY804258.1:66262490-66262509
TTGATATCTTCATTATAGAGTACTTGTACG66262490CCTAGCTCCATTTTTGCTGGTATTAGCATTCCGGCACTTACATAAGTAGT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A09.
CP030991.1:18687776-18687795
TCCTCAAACCCTAAATCCGAATTTTACACA18687776CCAGCAAAAATGGAGCTAGGCAAATGCAAATTACTTACAGTTTTGGTTAG
Polyommatus iphigenia genome assembly, chromosome: 12.
OY730189.1:9858808-9858827
ATTTAAAACAAAACTGTGCACTTCGGGACT9858808CCAGCAAAAATGGAGCTAGGTATGGACTATGGGGTCCTCAAAAATCATCA
Trididemnum clinides genome assembly, chromosome: 6.
OY776289.1:2419538-2419557
GTTTTTAAGCTGTATATTAGCTTTCTAGCA2419538CCAGCAAAAATGGAGCTAGGATCTTTTGTAGAAAGCCCCCGCCAATAATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTAGCTCCATTTTTGCTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTAGCTCCATTTTTGCTGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.151 | 0.142 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTAGCTCCATTTTTGCTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.242 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAGCAAAAATGGAGCTAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.244 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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