GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-14 16:33:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 15.
CP126440.1:17708530-17708552
AATAAATTTTAATCAATAACTAAAAAAATA17708530CCTCCCAATATAAAGCCACTACATTACATAAGGATTTCAGAATTAATCATACA
sat94a08.y1 Gm-c1062 Glycine max cDNA clone SOYBEAN CLONE ID: Gm-c1062-6183 5', mRNA sequence.
CA784116.1:148-170
TGTATGATTAATTCTGAAATCCTTATGTAA148TGTAGTGGCTTTATATTGGGAGGTATTTTTTTAGTTATTGATTAAAATTTATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTCCCAATATAAAGCCACTACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTCCCAATATAAAGCCACTACA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.332 | 0.323 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTCCCAATATAAAGCCACTACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.479 | 0.148 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTAGTGGCTTTATATTGGGAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.480 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).