GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:38:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:15650571-15650592
TAAACCTCAACTTCCTTTCTTTCCTCTCTT15650571CCTCTAGGACCAATAATAATGCCACCATTTTCGTAAGGTCGTCGTCTATATC
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:15442720-15442741
TAAACCTCAACTTCCTTTCTTTCCTCTCTT15442720CCTCTAGGACCAATAATAATGCCACCATTTTCGTAAGGTCGTCGTCTATATC
S.oleracea pgm mRNA.
X75898.1:113-134
TAAACCTCAACTTCCCTTCTTTCCTCTCTT113CCTCTAGGACCAATAATAATGCCCGCCATTTTCGTAAGGTCGTCGTCGTCGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTCTAGGACCAATAATAATGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTCTAGGACCAATAATAATGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.176 | 0.168 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTCTAGGACCAATAATAATGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.277 | 0.100 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCATTATTATTGGTCCTAGAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.277 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).