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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-04 19:15:27, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Prunus armeniaca genome assembly, chromosome: 3.
OZ177839.1:2949748-2949766
CTAGGCAATCCATAGCCCATGGGAGTCTCC2949748CCTGCCTCCGCCCTATTTATCACAGTTCACATAGCGTATCAATAGAACA
Bellardia viscosa genome assembly, chromosome: 1.
OZ280696.1:20542268-20542286
TAAGATAACCACCCTGTCTTATTTTTTAAT20542268CCTGCCTCCGCCCTATTTATGCAACCACTTAAATATTATAATCAAACAA
Macomangulus tenuis genome assembly, chromosome: 3.
OZ060662.1:75414227-75414245
TATTAACCCCGCAAGGATCTGTGTTTTATA75414227CCTGCCTCCGCCCTATTTATTTTCTTCGAAAACGTGATGTTGTTTACTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTGCCTCCGCCCTATTTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTGCCTCCGCCCTATTTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.304 | 0.295 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CCTGCCTCCGCCCTATTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.606 | 0.301 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=TAAATAGGGCGGAGGCAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.606 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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