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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 20:06:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Elaeis guineensis isotig09297.Elguifruit mRNA sequence.
JO096524.1:42-66
AGCAAAGTTCGCATTTTAAAGTCAGATCAA42CCTGCTATTGAATGCTTTGGTTGGGAAATATAATGATTAATATAGCAACAGTATA
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig21409.
LM626311.1:920-944
TATACTGTTGCTATATTAATCATTATATTT920CCCAACCAAAGCATTCAATAGCAGGTTGATCTGACTTTAAAATGCGAACTTTGCT
Elaeis guineensis 40S ribosomal protein S8 (RPS8) mRNA, partial cds.
KC146059.1:678-702
TATACTGTTGCTATATTAATCATTATATTT678CCCAACCAAAGCATTCAATAGCAGGTTGATCTGACTTTAAAATGCGAACTTTGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTGCTATTGAATGCTTTGGTTGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTGCTATTGAATGCTTTGGTTGGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.126 | 0.117 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTGCTATTGAATGCTTTGGTTGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.267 | 0.142 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCAACCAAAGCATTCAATAGCAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.268 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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