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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:33:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Erinaceus europaeus genome assembly, chromosome: 20.
OX485830.1:50140723-50140742
CATCCAGTTCTCCTGCCTTTTGCTGGCTGC50140723CCTTCCACTTTGATGGTTGCTAGGAAGAGTCCCCTTGAAAGCAGCATCCC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B04.
CP030996.1:130195515-130195534
AGACATTGATCTGAGCTCGATCTCTTCAAT130195515CCTTCCACTTTGATGGTTGCAAGTCACGCCAATCCACTGGCACATGTGAG
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 04.
CP049895.1:142891233-142891252
AGACATTGATCTGAGCTCGATCTCTTTAAT142891233CCTTCCACTTTGATGGTTGCAACTCACGCCTCTCCACTGGCACATGTAGG
Corylus americana cultivar Rush chromosome 4.
CP125817.1:10228230-10228249
TGTTGTGGATCTCAATCTCTCTCCAATCAT10228230CCTTCCACTTTGATGGTTGCACCATCCCAAATGGTCAAAGGATGGTCTCA
Arachis hypogaea EST, cultivar Minhua6, clone GFBZZHF01A7B1P.
LN675582.1:303-322
CCTACATGTGCCAGTGGAGAGGCGTGACTT303GCAACCATCAAAGTGGAAGGATTAAAGAGATCGATCTCAGATCAATGTCT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B04.
CP030996.1:130237603-130237622
CCTACATGTGCCAGTGGAGAGGCGTGACTT130237603GCAACCATCAAAGTGGAAGGATTAAAGAGATCGATCTCAGATCAATGTCT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 04.
CP049895.1:142933095-142933114
CTCACATGTGCCAGTGGATTGGCGTGACTT142933095GCAACCATCAAAGTGGAAGGATTGAAGAGATCGAGCTCAGATCAATGTCT
Corylus avellana genome assembly, chromosome: ca4.
LR899426.1:8881330-8881349
TGAGACCATCCTTTGACCATTTGGGATGGT8881330GCAACCATCAAAGTGGAAGGATGATTGGAGAGAGATTGAGATCCACAACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTTCCACTTTGATGGTTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTTCCACTTTGATGGTTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.297 | 0.288 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTTCCACTTTGATGGTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.530 | 0.234 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAACCATCAAAGTGGAAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.533 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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