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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 15:01:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

EST3248 Tender roots cDNA library of tea plant Camellia sinensis cDNA clone 08012802-OUYI_CHAG_39_34.M13+_B05, mRNA sequence.
GE652921.1:25-44
TATCGGCCATTACGGCCGGGGGCC25CGAAGACGTCCTCACTAGATCTCTCTGTTTACACACTCTAGATCTCTCTG
Raja brachyura genome assembly, chromosome: 1.
OY740781.1:107253373-107253392
CCTTATCACAGGTAGGCCCGTTCGTTCAGG107253373ATCTAGTGAGGACGTCTTCGGGCAGTCGCCATCTGTAGGCCCGCTCTATC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGAAGACGTCCTCACTAGAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGAAGACGTCCTCACTAGAT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.202 | 0.193 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGAAGACGTCCTCACTAGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.234 | 0.032 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCTAGTGAGGACGTCTTCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.235 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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