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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 11:26:59, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B09.
CP031001.1:132919470-132919489
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA132919470CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 09.
CP049900.1:131742979-131742998
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA131742979CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS42F04.
DH961593.1:383-402
ATTTAGGGCAAATTTACCAACGGATAAATT383AGACGTTAATGCATTGTGCGTGATCAAAATGCAGCGTCCCATTAATTAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGCACAATGCATTAACGTCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGCACAATGCATTAACGTCT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.166 | 0.157 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGCACAATGCATTAACGTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.270 | 0.104 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGACGTTAATGCATTGTGCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.271 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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