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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-02 23:31:54, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B09.
CP031001.1:132919470-132919489
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA132919470CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 09.
CP049900.1:131742979-131742998
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA131742979CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis hypogaea cultivar Yunnan Rainbow Peanut chromosome 19.
CP156106.1:133183978-133183997
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA133183978CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis hypogaea cultivar Huayu23 chromosome 19.
CP156126.1:134223753-134223772
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA134223753CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis hypogaea cultivar Chedouzi chromosome 19.
CP156146.1:134260850-134260869
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA134260850CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis hypogaea cultivar Laiyang Silihong chromosome 19.
CP156166.1:132114386-132114405
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA132114386CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis ipaensis isolate Y4 chromosome 9.
CP160338.1:134702225-134702244
CTTAATTAATGGGACGCTGCATTTTGATCA134702225CGCACAATGCATTAACGTCTAATTTATCCGTTGGTAAATTTGCCCTAAAT
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS42F04.
DH961593.1:383-402
ATTTAGGGCAAATTTACCAACGGATAAATT383AGACGTTAATGCATTGTGCGTGATCAAAATGCAGCGTCCCATTAATTAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGCACAATGCATTAACGTCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGCACAATGCATTAACGTCT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.183 | 0.174 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CGCACAATGCATTAACGTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.303 | 0.121 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AGACGTTAATGCATTGTGCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=43
0.304 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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