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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:59:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES26E10, 5' end sequence.
FY403673.1:718-738
TTAAAAAATCGATCGAAAAATTATATTTTA718CGGAATAGTTTGTTTAAGGCGAGTGTGTCTAGTAACCTCTCTCTTCTATTT
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.339.C2.
FX297144.1:165-185
TTAAAAAATCGATCGAAAAATTATATTTTA165CGGAATAGTTTGTTTAAGGCGAGTGTGTCTAGTAACCTCTCTCTTCTATTT
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES04G14, 5' end sequence.
FY383759.1:560-580
AACCAGAAGAGAGAGGTTACTAGAGACACT560CGCCTTAAACAAACTATTCCGTAAAATATAATTTTTCGATCGATTTTTTAA
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.339.C1.
FX297143.1:559-579
AACCAGAAGAGAGAGGTTACTAGAGACACT559CGCCTTAAACAAACTATTCCGTAAAATATAATTTTTCGATCGATTTTTTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGAATAGTTTGTTTAAGGCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGAATAGTTTGTTTAAGGCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.234 | 0.226 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGAATAGTTTGTTTAAGGCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.406 | 0.172 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGCCTTAAACAAACTATTCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.408 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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