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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:49:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 1.
CP126370.1:12364470-12364489
CGTTCCTGCGTCATCAGCTGCCGGCGGTGC12364470TGATGTCCCTTTTACCTCCGGATTAATCGAGCTAACTTAACGCACGTCGA
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 12.
CP126381.1:12360652-12360671
CGTTCCTGCGTCATCAGCTGCCGGCGGTGC12360652TGATGTCCCTTTTACCTCCGGATTAATCGAGCTAACTTAACGCACGTCGA
Musa acuminata subsp. malaccensis strain Doubled-haploid Pahang (DH-Pahang) genome assembly, chromosome: A01.
HG996466.1:4586931-4586950
CGTTCCTGCGTCATCAGCTGCCGGCGGTGC4586931TGATGTCCCTTTTACCTCCGGATTAATCGAGCTAACTTAACGCACGTCGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGAGGTAAAAGGGACATCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGAGGTAAAAGGGACATCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.171 | 0.162 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGAGGTAAAAGGGACATCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.256 | 0.084 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGATGTCCCTTTTACCTCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.258 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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